(工事中)

解析手法についてまとめていきます。

 

教員個人HPで多くのソフトウェア情報をまとめていますが、ここから研究室で現在よく使っている解析手法やソフトウェアを選んで紹介予定です。

 

遺伝解析

データ変換など

• GenAlex
• PGDspider
• TASSEL

 

多様性評価

• GenAlex
• diveRsity (R package)
• METAPOP2

 

 

クラスタリング解析

• STRUCTURE
  • • STRUCTURE harvester
    • CLUMPAK
• ADMIXTURE
  • • CLUMPAK
• TESS
• snmf

 

系統解析

• NeighborNet
• RAxML
• IQ-TREE

 

その他の遺伝解析

• PCA
• spatial PCA
• DAPC

 

 

地理情報システム解析

 

• ArcGIS Pro
• QGIS
• SAGA

 

• MaxEnt

 

統計解析

• R

 

 

その他